如果都是比较新的版本的升级可以参考下面的文章，
MySQL数据库的版本更新很快，新的特性也随之不断的更新，更主要的是解决了很多影响我们应用的BUG，为了让我们的MySQL变得更美好，我们有必要去给它升级，尽管你会说它现在已经跑得很好很稳定完全够用了。下面我们来看看几种常用的升级方法。
介绍之前，我们先做一些声明，MySQL采用二进制包来安装，升级都是在同一台DB Server上操作。
第一种，很简单，适用于任何存储引擎。
- 下载并安装好新版本的MySQL数据库，并将其端口改为3307（避免和旧版本的3306冲突），启动服务。
- 在新版本下创建同名数据库。
mysqldump -p3307 -uroot create mysqlsystems_com
- 在旧版本下备份该数据库。
mysqldump -p3306 -uroot mysqlsystems_com > mysqlsystems_com.bk
Note: 你也可以加上?opt选项，这样可以使用优化方式将你的数据库导出，减少未知的问题。
- 将导出的数据库备份导入到新版本的MySQL数据库中。
mysql -p3307 -uroot mysqlsystems_com < mysqlsystems_com.bk
- 再将旧版本数据库中的data目录下的mysql数据库全部覆盖到新版本中。
cp -R /opt/mysql-5.1/data/mysql /opt/mysql-5.4/data
Note: 大家也都知道这个默认数据库的重要性。
- 在新版下执行mysql_upgrade命令，其实这个命令包含一下三个命令：
mysqlcheck ?check-upgrade ?all-databases ?auto-repair
mysql_fix_privilege_tables
mysqlcheck ?all-databases ?check-upgrade ?fix-db-names ?fix-table-names
Note: 在每一次的升级过程中，mysql_upgrade这个命令我们都应该去执行，它通过mysqlcheck命令帮我们去检查表是否兼容新版本的数据库同时作出修复，还有个很重要的作用就是使用mysql_fix_privilege_tables命令去升级权限表。
- 关闭旧版本，将新版的数据库的使用端口改为3306，重新启动新版本MySQL数据库。到此，一个简单环境下的数据库升级就结束了。
第二种，同样适用任何存储引擎。
- 同样先安装好新版本的MySQL。
- 在旧版本中，备份数据库。
mkdir /opt/mysqlsystems_bk ; mysqldump -p3306 -uroot ?tab=/opt/mysqlsystems_bk mysqlsystems_com
Note: ?tab选项可以在备份目录mysqlsystems_bk下生成后缀为.sql和.txt的两类文件；其中，.sql保存了创建表的SQL语句而.txt保存着原始数据。
- 接下来在新版本的数据库下更新数据。
mysqladmin -p3307 -uroot create mysqlsystems_com
cat /opt/mysqlsystems_bk/*.sql | mysql -p3307 -uroot mysqlsystems_com ( Create Tables )
mysqlimport mysqlsystems_com /opt/mysqlsystems_bk/*.txt ( Load Data )
- 之后的所有步骤与第一种方法的后三步5、6、7相同。
第三种，适用于MyISAM存储引擎，全部是文件间的拷贝。
- 安装。
- 从旧版本mysqlsystems_com数据库下将所有.frm、.MYD 和.MYI文件拷贝到新版本的相同目录下。
3.之后的步骤依然同于第一种的后三步。
以上就是三种升级MySQL的方法，看似没有出现什么问题，其实，在实际的生产环境中，为会有诸多问题发生，这就需要我们在升级之前充分了解新版本中增加了哪些新功能，进一步分析升级以后这些新特性是否将会对我们原来应用产生影响
对于老版本的mysql升级可以看下一页。