大概步骤是：
把配置文件添加：skip-grant-tables参数，把basedir升级成新版本，启动mysql，执行命令：mysql_upgrade升级一下字典信息，然后flush privileges;刷新授权表，注意：如果是使用共享表空间，最好是把数据导出来再导入新版，如果是使用独立表空间可以使用mysql_upgrade升级。如：
1. shell > service mysqld stop #把实例停掉
shell > mv /usr/local/mysql /usr/local/mysql.bak #把mysql5.5.x的旧basedir改名为备份目录 shell > cp -ar /data/mysql3306 /data/mysql3306.bak #把mysql5.5.x下的实例数据备份一下，以免升级过程中发生意外 shell > tar vf xxx.tar.gz -C /usr/local #把mysql5.6.x的二进制包解压到basedir路径下，这里使用mysql5.6.27版本，下载地址：wget http://mirrors.sohu.com/mysql/MySQL-5.6/mysql-5.6.28-linux-glibc2.5-x86_64.tar.gz shell > cd /usr/local/ shell > ln -s mysql-5.6.28-linux-glibc2.5-x86_64 mysql #创建软连接 shell > cp -ar /usr/local/mysql.bak/my.cnf /usr/local/mysql/ #把旧版basedir下的配置文件复制回来，如果你的配置文件不是在basedir下，那这里就不用动
2.在配置文件的mysqld下添加：skip-grant-tables选项：
3.shell > service mysqld start #启动更新basedir之后的实例
4.使用mysql_upgrade命令：检查不兼容的表，更新grant表
shell > mysql_upgrade -P3306 -u root -p'xx' #命令输出除了warning外，表检查都必须要为OK，然后登录mysql（登录时的提示就可以看到新的版本号），
mysql > flush privileges;
5.去掉配置文件中的skip-grant-tables
6.看看错误日志有没有什么报错，此时就可以去验证下数据是否有异常，没有异常就表示升级成功了
注意：升级不可跳级，即5.1要想升级成5.6，必须先升级到5.5；所有步骤完成之后，最好再重启下mysqld